雖然他並沒有上陣殺敵建功立業，可為了朱慈烺的南征北戰保駕護航，也立下了不少的功勞。十二團營南下之時，李自成也曾派人刺殺過朱慈烺。
在暗衛孟樊超和親兵隊長杜忠仁的保護下，朱慈烺數次化險為夷。
朱慈烺“哦”了一聲：“對付李自成水師，用什麼辦法？”
杜忠仁站了出來，拱手說道：“太子殿下，闖賊得洞庭水師，其戰船不下百艘。加上大小民船，四五百搜是有的。而咱們，則一艘戰船都沒有，可是洪湖離著洞庭最近。咱們可以調撥洪湖戰船，再徵收長江沿岸所有的戰船。當可與闖賊一戰。”
朱慈烺皺了皺眉頭：“咱們沒有水師將士，僅有戰船又有何用？”
杜忠仁微微一笑：“江南子弟，又有誰不會水性。只要精通水性，便可與闖賊一戰。重要的，殿下忘了，咱們還有火器。”
“殿下，末將認為杜隊長的計劃可行。調撥長江各地船隻，不管大小戰船全部徵收過來。”
“對，咱們沒有水師，闖賊也不過是一群烏合之眾。末將覺得，咱們還有機會。”
“咱們可以把紅夷大炮搬到船上，流寇雖有戰船，然無火器。一旦開戰，他們根本就不是咱們的對手。”
洞庭湖是長江邊上的一個天然湖泊，洞庭湖對長江的水給下游起了一個緩衝調節的過程。也是長江水的一個很大的水源。
大明水師雖然沒落，可是長江沿岸的戰船尚在。而且，船隻經水路執行速度也快。只需兩到三個月，朱慈烺很快就能組建一支屬於自己的水師。
“杜忠仁，你會水麼？”朱慈烺問。
杜忠仁點點頭：“小人略識水性。”
“好，本宮就任命你為水師提督，三個月之內，打造戰船八百艘，可有問題？”
杜忠仁想了想：“報殿下，沒問題！”
兩個月後，杜忠仁回來了。這兩個月內，李自成數次發動衝鋒，可是始終跳不出朱慈烺的包圍圈。
當真是過街老鼠人人喊打，官兵羸弱的時候，李自成所向披靡。十二團營能打的時候，這些地方官兵似乎也打了雞血一般。
李自成南下廣西，被廣西總兵穆文龍堵了回去。穆文龍以獠人弓箭，上染劇毒，李自成的部將中箭者，多感染而死。
後來才知道，穆文龍用當地土著常用的方法，在弓箭手淬毒。或者，用人畜糞便。弓箭射中人體之後，很快就會繼發感染。在沒有抗生素的時代，很容易造成將士們死亡。
李自成南下廣西吃了大虧，只能調轉槍頭，往江西逃竄。
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